京东自营和旗舰店是京东平台上两种不同的店铺类型，它们在经营模式、产品来源、服务质量等方面存在一些区别。下面将从几个方面对京东自营和旗舰店进行比较。

1. 经营模式

京东自营是由京东自己运营的店铺，所有商品都是由京东自己采购、存储和发货。而旗舰店是由品牌厂商或授权经销商自己运营的店铺，商品由品牌厂商或经销商直接发货。

2. 产品来源

京东自营的商品来源比较广泛，既有京东自己采购的商品，也有来自品牌厂商和经销商的商品。而旗舰店的商品主要来自品牌厂商或经销商，因此旗舰店的商品更具有品牌的特色和代表性。

3. 价格优势

由于京东自营直接与供应商合作，没有中间商环节，因此在价格上相对更具竞争力。而旗舰店的商品价格可能会受到品牌厂商或经销商的控制，价格相对较高。

4. 售后服务

京东自营店铺提供的售后服务相对更加统一和规范，京东有自己的售后服务体系，可以提供更好的售后保障。而旗舰店的售后服务可能会因为品牌厂商或经销商的不同而有所差异。

5. 商品质量

京东自营店铺对商品的质量有一定的把控，京东有自己的质量检测体系，可以确保商品的质量。而旗舰店的商品质量则取决于品牌厂商或经销商的质量控制。

总结起来，京东自营和旗舰店在经营模式、产品来源、价格优势、售后服务和商品质量等方面存在一些区别。消费者在购物时可以根据自己的需求和偏好选择适合自己的店铺类型。